Юрий Федорович Самарин родился 3 мая 1819 г. в Петербурге в богатой дворянской семье. Его воспитанием занимался французский гувернер Пако и позднее Н. И. Надеждин. В 1834 г. Самарин поступил на словесное отделение Московского университета. В 1838 г. окончил Историко-филологическое отделение философского факультета Московского университета, получив право поступить на службу сразу в министерство. Большие связи в высшем свете и отличное образование обеспечивали молодому человеку блестящую служебную карьеру, которая, однако, не привлекала его.
Во время подготовки к магистерскому экзамену Самарин близко познакомился с К. С. Аксаковым, который также готовился к магистерскому экзамену.